С местами своего создания в АзНИИСА уделялось большое внимание подготовке научных кадров. Так, медицинские работники с институтом 1985-го года, проходившие обучение в аспирантурах, созданных в соответствии с научными центрами бывшего СССР и Азербайджана, были удостоены званий докторов философии и докторов наук. В тоже время были сотрудники, защитившие диссертации и получившие звание, как независимые диссертанты.
На основании Приказа Кабинета Министров Азербайджанской Республики №129 от 01.07.2010-года «Создание докторантуры и Правила приема в докторантуру» АзНИИСА получил разрешение на создание докторантуры. С 2011 года Международный прием в докторантуру научных кадров. Контроль и наблюдение за выполнением докторантами и диссертантами своих всегда был возложен на отдел «Научно-технической информации и докторантуры». За эти годы 18 человек стали диссертантами, трое из состоявшихся с успешным завершением своих диссертаций, были дипломами Высшей аттестационной комиссии при Президенте Азербайджанской Республики:
1. Джамалов Д. А. доктор тех. наук
2. Эйюбов И. Д. док. философия по тех.
3. Асадов Э. З. док. филосоии по тех.
В настоящее время количество диссертантов в институте пять человек было проведено в 2021-2022 уч.г.:
1. Юсифов Юсиф Низами оглы
2. Гараева Нигяр Видади кызы.